Mycobacterium tuberculosis clinical isolates genomes’ polymorphism
Полиморфизм геномов клинических изолятов
Mycobacterium tuberculosis
База данных генотипов и мутаций, приводящих к резистентности к изониазиду (INH), рифампицину (RIF), аминогликозидам (AG) и фторхинолонам (FQ), у клинических изолятов Mycobacterium tuberculosis
Database of Mycobacterium tuberculosis clinical isolates' genotypes and mutations, conferring resistance to Isoniazid (INH), Rifampicin (RIF), aminoglycosides (AG) and fluoroquinolones (FQ)
База данных поддерживается Уральским НИИ фтизиопульмонологии – филиалом Национального медицинского центра фтизиопульмонологии и инфекционных заболеваний Минздрава России, Екатеринбург, Российская Федерация
The Database is maintained by Ural Research Institute of Phthisiopulmonology – branch of the National Medical Research Center of Phthisiopulmonology and Infectious Diseases, Ministry of Public Heath of the Russian Federation, Ekaterinburg, Russian Federation
Генотипирование проводилось с использованием ТБ-БИОЧИП и СПОЛИГОЧИП тест - систем (ООО БИОЧИП-ИМБ, Москва, РФ)
Genotyping was carried out by microarray technology using commercial test system (TB-BIOCHIP and Spoligochip, BIOCHIP IMB Ltd, Moscow, Russian Federation)
Детектирование мутаций, приводящих к резистентности к противотуберкулезным препаратам проводилось с использованием ТБ-БИОЧИП тест - системы (ООО БИОЧИП-ИМБ, Москва, РФ)
Detection of mutations conferring DR was carried out by microarray technology using commercial test system (TB-TEST, BIOCHIP IMB Ltd, Moscow, Russian Federation).
Клинические изоляты были выделены в Ленинградской, Челябинской, Кемеровской областях и в Ставропольском крае РФ
Origin of clinical isolates: Chelyabinskaya, Leningradskaya, Kemerovskaya oblasts and Stavropolskiy kray of the Russian Federation
Генетический анализ был проведен в двух референтных центрах: Национальном медицинском центре фтизиопульмонологии и инфекционных заболеваний Министерства здравоохранений Российской Федерации (НМИЦ ФПИ), Москва, РФ и Уральского НИИ фтизиопульмонологии – филиала НМИЦ ФПИ, Екатеринбург РФ
Genetic analysis was done in two reference centers - National Medical Research Center of Phthisiopulmonology and Infectious Diseases, Ministry of Public Heath of the Russian Federation (NMRC PhID), Moscow, Russian Federation and Ural Research Institute of Phthisiopulmonology -Branch of NMRC PhID, Ekaterinburg, Russian Federation
Обозначения и сокращения в таблицах
Designations and abbreviations in tables
|
Лабораторный номер/ Laboratory number
|
Номер исследования клинического изолята, включающий сод референсной лаборатории, проводившей исследование (НМИЦ ФПИ – А, Уральский НИИ фтизиопульмонологии – U), четырехзначный номер клинического изолята, и последние две цифры – год, в котором проводилось исследование в референтных центрах Number of a clinical isolate analysis includes the code of the Reference centres: NMRC PhID - A, or Ural Research Institute of Phthisiopulmonology -U; four-digital number of the clinical isolate and two last figures of the year when an analysis in the reference Centre was performed |
|
wt |
wild type - no mutations detected/дикий тип – мутации не выявлены |
|
не опр/not ident. |
Not identified/ не определен |
ВИЧ-/HIV- |
ВИЧ+/HIV+ |